劉太崗——副教授
個人基本情況:
劉太崗,男,1982年生,山東泰安人。現為伟德BETVLCTOR副教授,碩士生導師。研究方向:機器學習、生物信息學、數學建模等。
已發表SCI論文20餘篇;主持國家自然科學基金青年項目1項,上海市教委創新項目1項,上海高校青年教師培養資助計劃1項,校博士啟動基金1項,參與國家自然科學基金面上項目2項;入選2018年上海高水平地方高校戰略創新團隊。
主要研究方向:
(1)機器學習基礎理論算法及其在生物醫學大數據建模中的應用;
(2)水産動物基因組數據挖掘及數據庫整合開發(與生命學院陳良标教授團隊聯合培養);
(3)生物信息學分析。
主持科研項目:
(1) 國家自然科學基金青年項目,11601324,基于多源信息融合的蛋白酶裂解位點預測算法研究,2016/01-2019/12,結題,主持。
(2) 上海市教委創新項目,13YZ098,蛋白酶裂解位點預測的生物信息學方法研究,2013/01-2015/12,結題,主持。
(3) 上海高校青年教師培養資助計劃,ZZhy12028,基于信息融合的蛋白質相互作用預測方法研究,2013/01-2014/12,結題,主持。
(4) 國家自然科學基金面上項目,41376135,洋山深水港病毒生物多樣性的宏基因組學研究,2014/01 - 2017/12,結題,主要參與人。
(5) 國家自然科學基金面上項目,31570112,藻類巨病毒噬病毒體(Virophage)的發現與鑒定,2016/01 - 2019/12,結題,主要參與人。
發表學術論文:
[1] Ding C, Han H, Li, Q, Yang X, and Liu T*, iT3SE-PX: Identification of Bacterial Type III Secreted Effectors Using PSSM Profiles and XGBoost Feature Selection, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2021, doi: 10.1155/2021/6690299. (SCI, 第一作者為2019級研究生)
[2] Yang Y, Zheng H, Wang C, Xiao W, Liu T*, Predicting Apoptosis Protein Subcellular Locations based on the Protein Overlapping Property Matrix and Tri-Gram Encoding, Int J Mol Sci, 2019, 20(9), doi: 10.3390/ijms20092344. (SCI, 第一作者為2015級本科生,保送南京大學)
[3] Xiuzhi Sang, Wanyue Xiao, Huiwen Zheng, Yang Yang, and Taigang Liu*, HMMPred: Accurate Prediction of DNA-Binding Proteins Based on HMM Profiles and XGBoost Feature Selection, Computational and Mathematical Methods in Medicine, 2020, doi: 10.1155/2020/1384749. (SCI, 第一作者為2018級研究生)
[4] Jun Wang, Huiwen Zheng, Yang Yang, Wanyue Xiao, and Taigang Liu*, PredDBP-Stack: Prediction of DNA-Binding Proteins from HMM Profiles using a Stacked Ensemble Method, BioMed Research International, 2020, doi: 10.1155/2020/7297631. (SCI,第一作者為2017級本科生,保送浙江大學)
[5] Peiying Tao, Taigang Liu*, Xiaowei Li, Lanming Chen*, Prediction of protein structural class using tri-gram probabilities of position-specific scoring matrix and recursive feature elimination, Amino Acids, 2015, 47: 461-468. (SCI,第一作者為聯合培養食品學院研究生)
[6] Xiaowei Li, Taigang Liu*, Peiying Tao, Chunhua Wang, Lanming Chen*, A highly accurate protein structural class prediction approach using auto cross covariance transformation and recursive feature elimination, Computational Biology and Chemistry, 2015, 59: 95-100. (SCI,第一作者為聯合培養食品學院研究生)
[7] Taigang Liu, Yufang Qin, Yongjie Wang*, Chunhua Wang*, Prediction of protein structural class based on gapped-dipeptides and a recursive feature selection approach, International Journal of Molecular Sciences, 2016, 17: 1. (SCI)
[8] Taigang Liu, Peiying Tao, Xiaowei Li, Yufang Qin, Chunhua Wang*, Prediction of subcellular location of apoptosis proteins combining tri-gram encoding based on PSSM and recursive feature elimination, Journal of Theoretical Biology, 2015, 366: 8-12. (SCI)
[9] Taigang Liu, Xingbo Geng, Xiaoqi Zheng*, Rensuo Li, Jun Wang, Accurate prediction of protein structural class using auto covariance transformation of psi-blast profiles, Amino Acids, 2012, 42: 2243-2249. (SCI)
[10] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng, Jun Wang*, Prediction of protein structural class using a complexity-based distance measure, Amino Acids, 2010, 38: 721-728. (SCI)
[11] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng*, Jun Wang, Prediction of protein structural class for low-similarity sequences using support vector machine and psi-blast profile, Biochimie, 2010, 92: 1330-1334. (SCI)
[12] Taigang Liu, Xiaoqi Zheng*, Chunhua Wang, Jun Wang, Prediction of subcellular location of apoptosis proteins using pseudo amino acid composition: An approach from auto covariance transformation, Protein and Peptide Letters, 2010, 17: 1263-1269. (SCI)
獲獎情況:
2012年,參加校青年教師講課比賽獲理工組一等獎; (校級)
2012年,上海大學生創新活動計劃項目立項,任指導教師; (市級)
2012年,獲上海高校青年教師培養資助計劃項目資助; (市級)
2013年,獲伟德BETVLCTOR教學先進個人獎; (院級)
2013年,獲上海市教委科研創新項目資助; (市級)
2013年,“首屆滴水湖大學生創新活動論壇”獲案例交流二等獎,任指導教師; (市級)
2014年,被評為“受學生歡迎的好老師”; (校級)
2014年,校人事考核優秀; (校級)
2015年,被評為“受學生歡迎的好老師”; (校級)
2015年,指導全國大學生數學建模競賽獲上海市一等獎; (市級)
2016年,被評為“受學生歡迎的好老師”; (校級)
2016年,《高等數學A》被評為“好課堂”; (校級)
2016年,入選三海人才“海燕計劃”; (校級)
2016年,指導全國大學生數學建模競賽獲上海市三等獎; (國家級)
2016年,指導全國大學生數學競賽獲全國二等獎2人次; (國家級)
2016年,上海海洋大學科學成果獎三等獎,排名第三; (校級)
2016年,獲國家自然科學基金青年基金項目資助; (國家級)
2017年,指導美國大學生數學建模競賽獲國際二等獎; (國際級)
2017年,指導全國大學生數學建模競賽獲上海市二等獎1項; (國家級)
2017年,指導全國大學生數學競賽獲全國一等獎1項; (國家級)
2017年,被評為“受學生歡迎的好老師”; (校級)
2018年,指導美國大學生數學建模競賽獲國際二等獎; (國際級)
2018年,被評為伟德BETVLCTOR“優秀課程導師(班主任)”; (院級)
2018年,被評為“受學生歡迎的好老師”; (校級)
2018年,獲“育才獎”;(校級)
2019年,指導全國研究生數學建模競賽獲全國二等獎一項;(國家級)
2019年,獲評數學建模優秀教學團隊(負責人);(校級)
2020年,被評為“受學生歡迎的好老師”; (校級)
2020年,獲教學名師榮譽稱号;(校級)
2020年,指導全國研究生數學建模競賽獲全國二等獎1項,三等獎2項。(國家級)
教學工作:
《高等數學》、《線性代數》、《概率論與數理統計》、《數學實驗與建模》
聯系方式:
E-mail:tgliu@shou.edu.cn
個人主頁:https://taigangliu.github.io/
聯系地址:上海市浦東新區滬城環路999号,伟德BETVLCTOR401室
郵編:201306